期待疗法：对于没有症状或症状较轻的的子宫内膜异位症患者尤其接近绝经期的患者一般可采取短期观察，不必急于用药或手术。
药物治疗：药物治疗是治疗子宫内膜异位症的主要方法之一，取得的效果也比较显著。药物治疗主要根据患者的年龄、生育要求、病变性质进行。药物治疗子宫内膜异位症虽然比较有效，但也存在一定的问题。药物治疗只能缓解症状，对于子宫内膜异位症的病变治疗作用不大;对有生育要求的患者不太适用。
手术治疗：目前治疗子宫内膜异位症的手术主要有两种：
1保守手术：对年龄轻、有生育要求的患者，在切除病灶同时尽量保留子宫和双侧附件或单侧附件。
2根除性手术：对于近绝经期妇女或年龄虽轻、药物治疗无效、病灶广泛、症状严重的患者，应采用全子宫及双侧附件切除术。
怀孕也是一种治疗：因为妊娠期性激素的变化、孕期的停经及哺乳期卵巢功能的低下对子宫内膜异位症病灶有抑制作用，所以，怀孕对子宫内膜异位症的治疗是有帮助的。应鼓励子宫内膜异位症患者尽快怀孕。
