1.单纯性脓肿的治疗可在截石位或侧卧下，用局麻或腰麻，在脓肿部位做放射状切口，放出脓液后，伸入示指探查脓腔大小，分开其间隔。必要时将切口边缘皮肤切开少许，以利引流，最后用凡士林纱条放入脓腔做引流。
2.脓腔与肛瘘相通的脓肿可在切开脓肿后，用探针仔细检查内口，然后切开瘘管，适当切除皮肤和皮下组织，内口周围组织也稍加切除，使引流通畅。如内口较深，瘘管通过肛管括约肌，可采用挂线疗法。以上手术优点是脓肿一期治愈，不再形成肛瘘。但在急性炎症中，找内口有困难时，不应盲目寻找，以免炎症蔓延或形成假道，仅做切开排脓，待形成肛瘘后，再做肛瘘手术。二期手术优点是效果准确，治愈率高。
3.术后护理此病治愈重在术后换药，切口常规换药，甲硝唑抗感染，使用紫草纱条覆盖创面，加用康复新液冲洗脓腔，并以浸有康复新液的纱条覆盖创面。脓肿术后采用康复新液配合常规药物换药，可在创面形成一层保护膜，不仅使创面保持湿润，而且还能促进切口肉芽组织生长，加快切口愈合。
