孩子发病的初期症状是发热多发生在皮疹之前，热程为2至7天不等，体温越高，热程越长，病情越重，伴有嘴角痛、咽喉痛、流口水、不爱吃东西，1至2天后，出现散在分布的皮疹，好发部位为手心、足心、口腔黏膜、肛周，少数患儿波及四肢及臀部，躯干部极少。潜伏期通常3至4天，可自愈。但是易于传播，口腔内的疱疹破了之后引起溃疡，疼痛难忍，影响孩子的食欲，如不及时治疗可并发脑炎、肺炎、心肌炎，引发重要器官损害。
小儿手足口病因为与几种常见病上呼吸道感染、水痘等很相像，不好鉴别，所以家长和老师应注意观察。
1.水痘：呈向心性分布，以头、面、胸、背为主，随后向四肢蔓延。
2.疱疹性咽颊炎：虽有发热，咽部起疱疹，但水疱如针眼大小，以咽颊、软腭、扁桃体多见，发热常在38℃以上，其他部位不出现疱疹。
3.单纯疱疹：多分布在颊黏膜、舌及牙龈，继发感染常见于口唇、眼睑、鼻周，为粟粒状水疱，没有其他部位的皮损。
如果小孩出现上述症状的时候，基本上能辨别是不是手足口病了，才能对症下药。
