1、发病年龄越来越小。近年来婴幼儿菌痢有增多趋势，这是因为婴幼儿饮食趋于多样化，有的婴儿辅食增加过早，品种增加过多。例如刚刚满月不久的婴儿，家长就开始给孩子喂西瓜水、苹果泥等，还有的家长过早地给孩子进食鱼虾、肉松等。这些食品在保存和喂饭过程中，很容易被病菌污染，因而增加了感染机会。
2、发病季节已不局限在夏秋季节。目前几乎全年都可以见到菌痢，甚至冬天婴儿菌痢也不少见，因为近几年来水果、鱼虾等食品一年四季都可以吃到，在冬天吃西瓜而感染菌痢的婴幼儿已屡见不鲜。
3、儿童菌痢容易与普通的腹泻混淆。年龄越小，其临床症状就越不典型。开始多为水样便，常常伴有呕吐，以后才出现大便次数增多，但大便量减少，变黏，出现黏液便等，反复发病的患儿还会出现脱肛的现象，如果不做大便化验很容易漏诊或误诊。因此，家长就诊前最好留一点大便，在2个小时内拿到医院检查。
4、容易演变为慢性菌痢。一般菌痢病程如果超过两个月即可诊为慢性菌痢。慢性菌痢因为长期腹泻，必然影响食物营养的消化与吸收，导致儿童生长发育障碍。
5、容易出现水、电解质紊乱和中毒症状。小儿肠壁较成人薄，但血管丰富，一旦肠道感染，更易导致脱水和毒素的吸收，发生高热、惊厥、神志障碍，甚至是中毒性菌痢而危及生命。所以，对于儿童菌痢要早治，千万不可掉以轻心。
6、孩子服药困难，常常不能坚持足够的疗程。许多对成人疗效不错的药物，如磺胺类(复方新诺明)、喹诺酮类(如氟哌酸)以及氨基糖甙类(庆大霉素、卡那霉素)药物都不适合儿童使用。第三代头孢(如菌必治)静点效果不错，但常常因为静脉输液带来的恐惧而遭到患儿和家长的拒绝。
