一般来说对男性影响不大，但也有导致一些疾病的记录，我曾在广播里听到过。而对女性来说，影响是极大的。阴道的解剖生理特点和阴道内的酸性环境，对女性生殖器官来说是一道天然的防御屏障，使之免遭细菌的侵袭。但在月经期，子宫内膜剥脱，碱性的经血中和了阴道的酸性环境，使天然屏障功能被削弱。
如果不注意经期卫生，甚至在月经期性交，将会把细菌带入生殖道内，极易引起感染。而且经血是细菌等微生物的良好培养基，子宫内膜存在着许多微小伤口和小血管破裂，细菌极易滋生，感染极易扩散。而且最容易导致女性不孕。经期性交，细菌可轻易地进入子宫腔引起炎症，甚至可累及输卵管和盆腔器官。由于炎症刺激，受精卵难以着床，而输卵管的粘连、堵塞更是造成不孕的直接因素。
经期性交还可因子宫的收缩使经血进入腹腔.有引起子宫内膜异位症的危险。经期性交，部分精子及精液的其他成分有可能经小血管裂口进入女性的血液循环，刺激免疫系统而形成抗精子抗体。可见，经期性交是导致女性不孕的重要原因。
