先天性弓形虫病的预后的较严重，无论有无症状，都必须治疗。后天性感染凡有症状者也都需要治疗。弓形虫眼病患者应同时加用肾上腺皮质激素治疗。
目前有一定疗效的药物有三种：
1.磺胺嘧啶和乙胺嘧啶并用急性期可合并应用。磺胺嘧啶50～150mg/kg·d，分4次口服，乙胺嘧啶1mg/kg·d，分2次口服，经2～4天后将剂量减半，每天最大剂量不超过25mg。两种药合用疗程约2～4周。乙胺嘧啶排泄极慢，易引起中毒，发生叶酸缺乏及骨髓造血抑制现象，故用药时给叶酸5mg口服，每天3次，或醛氢叶酸5mg肌注，每周2次，并可给酵母片口服以减少毒性反应。
2.螺旋霉素(spiravngcin)有抗弓形虫作用，且能通过胎盘，孕妇每天口服3g，脐带血中浓度高出3～5倍。有认为应用螺旋霉素可使胎儿先天感染减少50%～70%。本药对胎儿无不良影响，适用于妊娠期治疗。治疗方法常与磺胺嘧啶和乙胺嘧啶交替使用，20～30天为一疗程。先天性弓形虫病需用乙胺嘧啶-磺胺嘧啶2～4个疗程，每疗程间隔期为一个月，这时公用螺旋霉素治疗，剂量为100mg/kg·d，1岁以后可停止用药，待有急性发作时再重复治疗。
近来有报道复方新诺明对细胞内弓形虫特别有效，并容易通过胎盘，对胎儿弓形虫感染的疗效优于螺旋霉素。对人体霉性明显低于乙胺嘧啶-磺胺类。
弓形虫脉络膜炎应先用乙胺嘧啶-磺胺嘧啶20～30天，然后用螺旋霉素加用皮质激素强的松治疗1～2mg/kg·d，直至炎症病变吸收，逐渐减量至停药，以免发生临床反跳现象。
