内分泌失调的药物治疗可采用中西医结合的方法，以中西医结合互补为主要原则。
中医：从中医上来说，内分泌失调是阴虚的表现，是由气血淤滞所造成。淤血滞留体内、脉络受阻、外毒入侵人体、产后恶露不下等都可能会引致气血淤滞。很多妇科常见病，其实都是由于内分泌失调所引起。因此，治疗这些病症，要从调节内分泌入手，要令气血通畅，使精血滋养全身，促进血液循环，由内而外的全面调理。根据中医的辨证施治原则，对功能亢进者应多注意养阴治疗，而对于功能减退者往往表现有气血两虚、肾虚等，一般是给予补血益气，补肾等药物进行治疗，使情况得以改善。
西医：对于内分泌失调，西医治疗的指导原则当然是调节内分泌，使之重新达至平衡。针对不同的病因、症状及体质、严重程度，会有不同的应对方法。通常对激素分泌过多造成的功能亢进，以抑制、消减为原则，可以采取手术切除内分泌肿瘤，或用药物抑制激素的分泌和合成;对激素分泌过少造成的失调，原则上是补充其不足，包括补充生理剂量激素，器官移植等。
