1、卵巢病变：包括先天性卵巢发育不全，多囊卵巢综合症，卵巢功能早衰，卵巢肿瘤等。
多囊卵巢综合征：常表现为闭经或月经稀发，长期无排卵，雄激素过多，雌激素无周期性波动。是目前无排卵性不孕的一个主要原因。
卵巢功能早衰：发生在40岁以前的由于卵巢功能衰竭所致高促性腺激素性闭经称为卵巢早衰，约占原发闭经的20%-28%左右，继发闭经的4%-20%。
2、下丘脑-垂体-卵巢轴功能紊乱：引起无排卵月经、闭经;常因紧张、焦虑、愤怒、忧伤等不良情绪，而致脑部功能失调引起不排卵或排卵不正常;因席汉氏综合征、高泌乳血症引起不排卵等。
3、全身疾病：重度营养不良，甲亢等疾病均可引起不排卵。
4、药物影响：服用某些药物，如长效类的固醇注射避孕药破坏脑和卵巢之间的互动，压制排卵从而防止怀孕。有迹象显示，使用这种避孕方法的时间越长，闭经的可能性也就越高。
