1.检查意义不同：
乙肝五项检查主要是用来判断是否感染乙肝，粗略估计病毒复制水平的初步检查，用来区分大、小三阳。而肝功能检查，是判断患者肝脏是否受损，对于查明肝病原因、判断预后和鉴别发生黄疸的病因有着非常重要的意义。
2.检查项目的不同：
乙肝五项检查是：乙肝表面抗原、乙肝表面抗体、乙肝e抗原、乙肝e抗体、乙肝核心抗体，这五个检查项目。而肝功能的检查项目是有很多的，需要根据不同的病情进行相应的检查，比较常见的有：转氨酶、总胆红素、直接胆红素、间接胆红素、白蛋白、球蛋白等。
3.检查的指标要求等有所不同，由于乙肝五项检查，和肝功能检查检查的意义不同，所以他们的指标和要求也是会有所不同的。乙肝五项检查是用阴性和阳性来表示的，而肝功能检查就比较复杂了，不同的检查项目，意义不同所出现的指标也是有所不同的。
4.检查的要求不同，乙肝五项检查是检查乙肝病毒的一个指标，不需要进行空腹。而肝功能检查是检查体内肝脏情况的一个指标，为了检查结果的准确性，患者必须空腹检查，并要注意饮食清淡，不能熬夜，检查前不能剧烈的运动。
