方法一：
双向琼脂扩散法：1970年以前主要用双向琼脂扩散法，其阳性率虽不高，但诊断原发性肝癌的特异性却较大。不过随着检测方法的不断改进和完善，双向琼脂扩散法检测甲胎蛋白的方法准确性已经不能满足需求。
方法二：
放射免疫法：现在，测甲胎蛋白一般通过抽血检查，最常用的检测方法就是放射免疫法。这个方法检测的甲胎蛋白正常值为0—25μg/L，如果超过25μg/L则为阳性，如果在25-400μg/L之间为低浓度阳性，超过400μg/L即为高浓度阳性。如果检查出阳性，则需要进一步做综合检查，结合定位检查如B超、CT、磁共振(MRI)和肝血管造影等作出诊断确定是否为肝癌疾病。
此外，如果孕妇甲胎蛋白检测数据偏高，这还很可能意味着胎儿有缺陷，这时候必须要再结合临床经验、B超结果进行更全面的诊断。
方法三：
化学发光法：化学发光法也是检测甲胎蛋白的常用方法之一，其因操作简单、灵敏度高、特异性强等优点在临床上被广泛应用。另外，化学发光法相对于放射免疫法，其在测定上大大缩短了放映时间，而且没有放射性污染，满足临床需求。
方法四：
其他方法：甲胎蛋白检查，目前常用的方法还有酶标法、酶标电泳法检测。一般认为，这些方法检查后得出的数值，>400毫微克/毫升、>200毫微克/毫升，持续8周，而谷丙转氨酶正常，并排除妊娠和生殖腺胚胎瘤，可以确诊为原发性肝癌。
