蒸馏水是利用蒸馏的方法将水蒸汽化，使水蒸气凝成水，去除水中含有的重金属离子的同时，也去除了人体所需的微量元素，但却没有除去低沸点的有机物。虽然多喝水的好处很多，但长期饮用蒸馏水，不仅会引起某些微量元素的缺乏，也会将某些有机物饮入体内，不利于健康，因此不宜经常饮用。蒸馏水对人体的作用，只是很单纯地担任运输工作，比如将细胞组织所拒绝的物质带出体外。
矿泉水是指从地下深处自然涌出的或经人工揭露的、未受过污染的地下水。矿泉水是在地层深部循环生成的，含有多种矿物质元素和微量元素。由于人的身体条件各有不同，所需微量元素的种类和数量也不同，所以矿泉水的微量元素和离子并不能对每个人都有益。
蒸馏水与矿泉水的最大区别在于矿物质元素的含量，蒸馏水将水中的盐、铁等重金属和矿物质最大限度的去除，只保留水分子，在除去了有害物质的同时，也将有益物质去除;而矿泉水则把水中的一些矿物质和微量元素保留了下来。
目前市面上出售的蒸馏水可选择不多，在包装上与一般矿泉水也没有什么不同，导致很多人把蒸馏水跟矿泉水混淆。
