透骨草是多年生草本植物,高(10-)30-80 (-100)厘米。茎直立,4棱形,不分枝或于上部有带花序的分枝,分枝叉开,绿色或淡紫色,遍布倒生短柔毛或于茎上部有开展的短柔毛,少数近无毛。叶对生;叶片卵状长圆形、卵状披针形、卵状椭圆形至卵状三角形或宽卵形,草质,长(1-)3-11(-16)厘米,宽(1-)2-8厘米,先端渐尖、尾状急尖或急尖,稀近圆形,基部楔形、圆形或截形,中、下部叶基部常下延,边缘有 (3-)5至多数钝锯齿、圆齿或圆齿状牙齿,两面散生但沿脉被较密的短柔毛;侧脉每侧4-6条;叶柄长0.5-4厘米,被短柔毛,有时上部叶柄极短或无柄。[2] 穗状花序生茎顶及侧枝顶端,被微柔毛或短柔毛;
花序梗长3-20厘米;花序轴纤细,长(5-)10-30厘米;苞片钻形至线形,长1-2.5毫米;小苞片2,生于花梗基部,与苞片同形但较小,长0.5-2毫米。花通常多数,疏离,出自苞腋,在序轴上对生或于下部互生,具短梗,于蕾期直立,开放时斜展至平展,花后反折。花萼筒状,有5纵棱,外面常有微柔毛,内面无毛,萼齿直立;花期萼筒长2.5-3.2毫米;上方萼齿3,钻形,长1.2-2.3毫米,先端多少钩状,下方萼齿2,三角形,长约0.3毫米。[2]