1、胃肠道问题
插入到转基因大豆里的基因转移到生活在我们肠道的细菌的DNA里面去，并继续发挥作用。这意味着吃Bt玉米所造成的玉米片，会把我们的肠道细菌转变成生活着的农药制造厂，可能直至我们死为止。美国人在过去十年中，有着大幅增加的胃肠道的问题。这种大量增加，医生多认为食用转基因食品造成的。最严重的问题还不止于此。
2、心脑血管疾病
这些转基因大豆里，被他们的生物科学家植入了饱和脂肪基因。这些基因导致转基因大豆生产出来的豆油，在进入人体以后，会形成大量的饱和脂肪，增加了血液的血粘稠度，为脂肪肝、高血脂、脑血栓等重大心脑血管疾病埋下了慢性定时炸弹。
3、引发新疾病
转基因技术采用耐抗菌素基因来标识转基因化的农作物，这就意味着农作物带有耐抗菌素的基因。这些基因通过细菌而影响我们。英国的研究显示，转基因作物中的突变基因可能会进入到生物体内，其结果可能会导致新的疾病。如果类似结果发生在人和动物体内，就可能培养出功效最强的、抗菌素也无法杀死的超级细菌。
