一、对神经方面的伤害
接种天花疫苗会造成神经方面的伤害在医学界已经是众所皆知，如今又发现百日咳疫苗(whooping cough)也会造成神经方面的伤害，可能造成的后遗症包括了脑炎、痉挛、髓膜炎，较轻的症状则会让人的学习能力减低或是使人轻微的行动不便。在美国提出的报告已建议接种者的本人或家庭中有痉挛病症者不要接种百日咳疫苗;在德国及瑞典更是认为接种百日咳疫苗的后遗症比得到百日咳更为严重而全面停止此疫苗之接种。在美国因为接种此疫苗而受害的人数之多，要求的赔偿金额已达到最大的疫苗制造商面临倒闭的危机，而在此所指的受害者仅是指人体已经受害达到百分之八十的残废者，尚未包括那些较轻的受害者。一篇法国的医学报告指出，曾经有过神经方面伤害的儿童、本人或家庭有癫痫病例者，或是得了严重的慢性病的儿童若接种百日咳疫苗会有很大的危险性。除了身体的后遗症之外，在接种天花疫苗后的数周到数月之内，常会有情绪上的问题产生，这种情绪上的问题会持续一年到十一年之久。接种疫苗使得儿童无法专心，进而导致焦虑不安。尤其是我们的社会提倡每人都得接种，在每人都受接种的情况下，使得这种情绪上的问题不再只是个人的问题，而是影响到整个年龄群。这些群体的情绪现象包括无生气、被动、对大部分的事情提不起兴趣、畏缩等。
二、接种疫苗可能引发及传染艾滋病
根据英国《泰晤士报》(Times)在一九八七年五月十一日登载指出，非洲国家之所以会开始有艾滋病，都是因为在一九七○年到一九八○年间，世界健康组织所倡导的天花疫苗接种活动所种下的因;巴西是中、南美洲艾滋病最严重的国家，也是中、南美洲唯一全面倡导接种疫苗的国家。艾滋病是在一九七八年才发现的新疾病，主要的传染媒介是经由血液、精液，而目前有一些疫苗的制造是经由血浆或是人的胚胎来培养的。在一九八一年，发生了一批被病菌感染的血液被用来制造疫苗而且被大量使用的丑闻，在当时并没有检验艾滋病毒的程序，令人不禁怀疑，如果这批疫苗感染了艾滋病毒，则它们对整个世界造成了什么样的影响?美国有两位研究艾滋病的专家提出，他们怀疑所有使用非洲猴子细胞培养的药或疫苗均是散播艾滋病病毒的原因之一。书上并指出接种疫苗后几天(尤其是第三到第四天)会导致人体的免疫功能降低，这一段时期的现象和得了艾滋病很相似，所以有医生指出，小孩子的免疫功能正在发展时期，而在此时接种疫苗让他们经历这种「艾滋病类似期」将会造成何种的影响?有个病历是一位美国士兵在连续接种数次疫苗(其一为天花疫苗)后得了天花，进而演变成艾滋病而导致死亡。据报告是因为天花疫苗引发了他体内潜伏的HIV病源，而连续的接种则加速了艾滋病的发病。
三、接种疫苗是癌症及血友病的温床
早在四十年前即有一位医师提出「接种疫苗会激发血友病」，这已是医学界众所皆知的，如今更有医生深信连续的接种是造成癌症的温床，因为接种天花疫苗而不久之后得了血友病的病例也是层出不穷。根据医学界的研究及实际的病例都一再地显示疫苗接种，尤其是由活的细菌培养的疫苗均可以促成癌症病变。这些细菌可以在人体潜伏数年而经由服用可体松、照射紫外线或是因为其它病菌的存在而引发癌症、肌肉硬化症，甚至于艾滋病。在过去的数十年间，已经有多次人们接种由活细菌培养之疫苗(包括感冒、黄热病、天花疫苗等)，事后才发现疫苗本身被病菌感染的事件。这种事件通常都是科学家在发现某种新的病菌后，才发现原有的疫苗制造方式已被感染，而通常这种已感染的疫苗早已被广泛地使用数年或数十年而不为人所知。这种已感染的疫苗中的病菌不止本身具有危险性，它们还可以自行结合或与疫苗的细菌结合而产生新的疾病，这些新的疾病即包括了癌症。
