错颌畸形病因学的研究，对错合 畸形的矫治设计和预防有重要价值。在错颌畸形的矫治中，病因的分析，与矫治方针的设计和判断预后都有密切的关系。临床上，错颌畸形通常表现为与正常的生长和形态范围变化甚大。它的形成因素和机制是错综复杂的。其发生的过程，可能由单一因素及单一机制在起作用，也可能是多种因素或多种机制共同作用的结果，难以区分主次。错颌畸形的病因大体分为先天因素和后天因素两大类，但是要确定某一错合主要是遗传因素或环境因素，还是二者兼而有之是较难的。这些因素影响或作用于颌面部骨骼、牙列、神经肌肉和咀嚼系统软组织的生长发育，使其发生异常改变继而形成错颌畸形。
遗传因素 种族演化 个体发育
环境因素 错颌畸形的病因，除遗传因素之外，还有环境因素。环境因素(environment)可分为先天因素和后天因素。它们之间相互联系，不能截然分开。而且，环境因素和颌面部的功能是密切相关的。
先天因素 包括母体因素、胎儿因素以及常见的发育障碍及缺陷(多生牙、先天性缺失牙、牙大小形态异常等)。
后天因素 例如某些急性及慢性疾病、佝偻病、营养不良等。
功能因素 例如吮吸、咀嚼、呼吸功能异常。
口腔不良习惯 常见吮指习惯、唇舌习惯以及偏侧咀嚼习惯。
乳牙期及替牙期的局部障碍 乳牙早失、滞留，恒牙早失、早萌以及萌出顺序紊乱。
