扁平疣西医治疗：
1、手术切除治疗扁平疣：皮肤科专家不主张手术切除扁平疣的方法。这是因为，手术往往切不干净，很容易复发，并且遗留瘢痕，为继续治疗带来更大难度。
2、腐蚀性药物治疗扁平疣：南通皮肤科专家也不建议用这种方法，因为多数疣在1-2年会自然消退，民间故有"千日疣"一说;且即使使用腐蚀性药物，疣仍有复发的可能。特别是面部的疣，会留下瘢痕，影响美容。
3、全身治疗：聚肌胞，板兰根肌注或内服左旋咪唑，乌洛托品。
4、局部治疗：液氮冷冻或镭射治疗，外用鸦胆子仁，疣必治等。
对数目较多，经久不愈者可口服乌罗托品，0.3～0.6g/次，3次/d，或氧化镁，0.5g/次，3次/d，可试用α，γ-干扰素，聚肌胞，土贝母等肌肉注射，局部可外用0.5%酞丁安擦剂，干扰素α-2b涂膜剂，1%喷昔洛韦霜，0.025%维A酸(维甲酸)霜等，颜面部慎用激光，冷冻治疗，也不用腐蚀性强的药物，以防色沉斑，瘢痕形成，影响美容，手背部可选用各种物理疗法(同寻常疣)。
扁平疣中医治疗：
局部治疗：中医外治可用紫蓝方(见寻常疣全身疗法)酒浸外搽或用雄黄解毒散加入百部酒外用，亦可用黑色拔膏棍，加温外贴，5～6天换1次，或用鸦胆子仁捣碎外敷(注意保护周围皮肤)，亦可用木贼，香附，板蓝根，山豆根，煎水泡洗患部。
