痤疮主要与皮脂分泌过多、毛囊皮脂腺导管的堵塞、细菌感染和炎症反应等因素密切相关。痤疮发生的基本病理生理基础是皮脂腺的快速发育和皮脂的过量分泌，青春期雄性激素水平快速上升促进了皮脂腺的发育并产生大量皮脂。
毛囊皮脂腺导管的异常角化是另一个重要因素：由于角质细胞的异化，导致角质层增厚和角质物堆积，使毛囊皮脂腺导管堵塞、皮脂排出障碍，最终形成角质栓也就是粉刺。
大量皮脂的分泌和排出障碍容易继发细菌感染。毛囊中存在多种微生物，如痤疮丙酸杆菌、白色葡萄球菌和糠秕马拉色菌，其中以痤疮丙酸杆菌最为重要，该菌为厌氧菌，皮脂的排出受阻，正好为其创造了良好的局部厌氧环境，使痤疮丙酸杆菌大量繁殖，导致和加重炎症性损害。
除上述因素外，部分患者痤疮的发生还和肌体的免疫状况以及遗传有关，特别是在一些特殊类型的痤疮如聚合性痤疮和暴发性痤疮中，免疫反应发挥重要作用。
