急性鼻窦炎可以出现头痛，畏寒，发热、鼻腔流脓涕，周身不适、精神不振、食欲减退等，儿童患急性鼻窦炎时，可伴有高热，并会发生抽搐、呕吐和腹泻等症状。未经正规治疗经常会转变成慢性鼻窦炎，急性鼻窦炎还可以向外扩散，引起中耳炎，咽喉炎，扁桃体炎等，甚至有时候会引起少见的眶内感染。鼻窦炎的头痛有一定的规律，随不同的鼻窦感染而有所不同。
慢性鼻窦炎的患者大多病程冗长，患者经常流脓涕、头痛、记忆力减退，给生活、工作带来诸多不便和影响。脓液向周围扩散，可导致周围组织的感染，甚至可引起失明、脑膜炎、脑脓肿等严重后果，但随着抗菌素的广泛应用，这种严重后果的并发症已经极为少见。
由于脓涕流入咽部和长期用口呼吸，常伴有慢性咽炎症状，如痰多、异物感或咽干痛等。若影响咽鼓管，也可有耳鸣、耳聋等症状。小儿的慢性鼻窦炎还可以严重影响学习成绩，导致成绩下降.慢性鼻窦炎还可以做为一个病灶，导致附近器官的感染。鼻窦炎还可以引起哮喘发作，对有鼻窦炎的哮喘病人，应先进行鼻窦炎的治疗。
