(1)儿童骶骨弯曲尚未形成,两侧坐骨结节的距离较近,加之肛门内括约肌的张力较弱,故粪便易直接压迫肛管齿状线处,肛窦粘膜擦伤,易使细菌侵入发病;女孩因直肠在子宫前方,压迫直肠,与成人直肠弯曲相似。因此,发病率比男孩低。
(2)儿童常因尿布皮炎,刺激肛门周围皮肤,造成毛囊、汗腺、皮脂腺的感染,形成肛周皮下脓肿和肛窦,成为肛瘘。
(3)新生儿,尤其是男孩,由于母体激素分泌失调,引起皮脂腺分泌旺盛,造成肛门皮脂溢出。感染后形成肛周皮下脓肿,与肛窦相通,导致肛瘘。
(4)近年来,有人认为新生儿在生理上缺乏免疫球蛋白G(IgG)和免疫球蛋白A(IgA),免疫功能低下,因此容易发生肛门感染,形成肛瘘。