第一 心脏神经官能症与其它种类心脏病的治疗截然不同。既然引起胸痛的根源在于神经系统功能失调，所以病人首先要树立治疗信心。其次消除诱因，如忧虑、紧张、烦恼;纠正失眠;避免过度劳累和环境嘈杂不良因素的影响。此外，还要适量参加文体活动。必要时服以少量药物协助治疗，如安定类、健脑类、维生素类等，或者辨症选用中成药，均可取得良好的治疗效果。
第二、胃肠神经官能症用药主要用来调节神经功能，改善睡眠。根据病情，可选用下述药物与方法：1、解痉止痛：选用使平滑肌松弛，有解痉止痛作用的药物。2、胃神经官能症其它治疗方法尚可采用针灸、理疗等。
第三、目前中药因为副作用小，疗效巩固而越来越受到欢迎。选用中药时遵循的原则为平衡阴阳。多数临床选用以疏肝理气，豁痰开窍，重镇安神，育阴潜阳为主，补其不足，泻其有余，用来调节中枢神经兴奋与抑制失调状态，修复受损神经，平衡脑神经，营养脑神经，提高机体免疫力。 另外，中药还可以扶正祛邪，消除饮食不调、劳逸无度所致发病因素，以清热利湿、理气活血、消食祛痰为主，重在清除致病因素，减少对脑神经的损害，促进有害物质的分解，改善微循环，提高耐氧能力，解痉止痛，改善食欲和睡眠。
