扁平疣不是扁平湿疣，扁平湿疣(Condyloma flant)为二期梅毒疹，发生于生殖器和肛门等处。一般有三种，即单纯性、溃疡性和肥大性，起初损害为集蔟性红色柔软、扁平的丘疹。由于某些刺激后，扁平丘疹可呈灰褐色。有时类似疣体呈扁平斑块状的尖锐湿疣可融合成斑片状，无蒂，呈扁平匐进性扩展(单纯性)。也可增殖融合成肥厚性斑快，高低不平，触之坚实，比较平滑(肥厚性)。可因局部潮湿、摩擦等使表面有分泌物、糜烂，甚至形成溃疡(溃疡性)。这种发生在皮肤粘膜的特殊类型的二期梅毒诊，需与尖锐湿疣鉴别，但扁平尖锐湿疣皮疹内发现大量梅毒螺旋体，传染性较大。USR、VDRL、TPL等化验阳性，而尖锐湿疣阴性。临床上有时压紧的尖锐湿疣团快类似扁平湿疣，用棉签将其拨开即可见明显分开的乳头状疣体，仔细观察即可区别。
根据最新的《阿克曼外科病理学》，扁平湿疣被认为与尖锐湿疣一样，同为HPV感染引起的皮肤病变，而且《阿克曼外科病理学》随后严肃的指出，要严格的区分扁平湿疣和梅毒湿疣，这是两个完全不同的概念。
