牙周炎的治疗应分一定阶段进行。
1、第一阶段应该是基本的牙周治疗。这适用于每个患有牙周病的病人。对于出现急性牙龈脓肿、急性牙周脓肿、急性坏死性牙龈炎等急症的患者，应根据情况进行治疗。拔除无望保留的牙齿，以在较长的时间内保持牙周健康。进行洗牙、洁牙和根管治疗，以清除龈上和龈下的菌斑、牙石和坏死的牙骨。必要时，对松动的牙齿进行临时固定、粘接和药物辅助治疗。这一阶段的任务是消除局部致病因素，提高病人的认识。因此，对患者进行口腔卫生指导，纠正他们的不良习惯很重要。应让病人了解牙周炎的原因和建立良好口腔卫生习惯的重要性。应教给病人清除牙菌斑的方法，如正确的刷牙方法和正确使用清除牙菌斑的工具，如牙线、牙签和间隙刷。基本治疗后应重新评估疗效。
2.手术治疗
基本治疗后2-3个月，要重新评估牙周状况。如果探诊深度仍超过5毫米，部分牙位探诊出血，或根分叉病变为I-II度，或牙龈和牙槽骨形态不佳，则需要手术治疗。牙周手术不仅可以在直视下进行彻底的根面平整和清除感染组织，还可以纠正不良的牙龈外形、不良的牙槽骨形态、根分叉病变，并可进行牙周组织的再生治疗。
牙周炎的修复和正畸治疗是基于基本的牙周治疗，以改善患牙的松动、位移和咀嚼无力等症状。这一阶段的治疗必须在牙周炎症得到控制的情况下进行，通常在治疗后3个月（手术后）进行。其根本目的是分散内聚力，消除创伤，建立和谐的内聚关系，建立稳定的平衡内聚力；固定松动的牙齿，修复缺损的牙齿，控制病理性松动移位，促进牙周病变组织的愈合，恢复咀嚼功能。
