女性支原体感染的治疗方法要根据该病的特征以及病因来选择适合自己的方法，支原体、衣原体感染人体后，首先侵入柱状上皮细胞并在细胞内生长繁殖，然后进入单核巨噬细胞系统的细胞内增殖。当人体感染支原体、衣原体后，产生特异性的免疫，但是这种免疫力较弱，持续时间短暂，因此，支原体、衣原体感染容易造成持续，反复感染，以及隐性感染。
妇女感染支原体、衣原体后，不一定会出现症状，即使有症状，也因感染部位的不同而有所不同，例如子宫颈感染后可出现宫颈糜烂、宫颈黏膜水肿、白带增多(呈脓性)、接触性出血等女性支原体感染治疗很重要，如果不及时进行治疗，支原体感染常见的合并症为输卵管炎，少数患者可出现子宫内膜炎及盆腔炎。这样容易造成不孕症的发生，专家提醒成人主要通过性接触传播，新生儿则由母亲生殖道分娩时感染。成人男性的感染部位在尿道粘膜，女性感染部位在宫颈。新生儿主要引起结膜炎和肺炎。
在选择女性支原体感染的治疗方法之前，患者还应注意一些事项，这样才能保障得到很好的效果，女性支原体感染不限于尿道，可累及整个泌尿生殖器官，此类感染常因缺乏自觉症状或症状轻微而忽视了治疗，导致传染源继续扩散，形成危害。无症状女性支原体感染(缺乏症状反应)：由于本病缺乏自觉症状，则局部症状便成为诊断的一个重要指标，表现为阴道有脓样分泌物，亦可为粘液或浆液性。
