对于复合彩光祛斑的副作用，偶尔会有引起皮肤色素性改变的潜在风险。另外人体个体是有非常大的差异的，少部分人可能会出现色素沉着斑，极少数人可能会出现痤疮样发疹和水疱。
另外，复合彩光祛斑偶然会见到光过敏的情况发生，如痤疮样发疹、风团等。但持续时间很短。据长期的临床研究复合彩光没有致癌作用，因为复合彩光没有紫外线，而紫外线里包含致癌光波。彩光祛斑如果治疗之后不再维持，皮肤会按照其自然发展进行，不会出现加速老化或松垂现象。
一般治疗后并不需要特殊的护理，只需要冷敷半小时左右。术后7—10天内，色斑处出现颜色加深、结痂脱落的过程，应该避免强光暴晒及使用刺激性化妆品，避免强行剥离色素痂皮。彩光祛斑后一周内不要去角质、不要使用含果酸、A酸类护肤品，一定要做好保湿工作，医生视求美者的具体情况，会建议求美者配合使用表皮细胞再生液(修复肽)及修复面膜，以加速皮肤各种问题的改善。
