某些药物导致。
临床患者采用抗生素(红霉素、庆大霉素、氯霉素、卡那霉素、氨苄青霉素等)进行治疗时，会导致碱性磷酸酶偏高，同时，用巴比妥类药物治疗时也会出现碱性磷酸酶偏高。像这种药物导致的碱性磷酸酶偏高，一般是不需要进行特殊的治疗，停药后即恢复正常。
骨骼疾病。
由于骨组织中碱性磷酸酶也很活跃，因此如果有骨骼疾病的患者会出现碱性磷酸酶偏高。如：佝偻病、软骨病、骨折愈合期、骨质疏松、骨恶性肿瘤、恶性肿瘤骨转移等骨骼疾病的患者一般会出现碱性磷酸酶偏高。
肝胆疾病。
由于肝脏细胞中碱性磷酸酶最多，因此如果肝胆出现问题，碱性磷酸酶偏高是必然的。临床如：阻塞性黄疸、病毒性肝炎、肝癌(原发性、继发性)、肝硬化、胆汁淤积性肝炎等都可引起碱性磷酸酶偏高。
怀孕期间。
临床孕妇也会出现碱性磷酸酶偏高的现象，导致孕妇碱性磷酸酶偏高的原因是孕妇的新陈代谢增强，导致肝脏不甚重负，从而使肝功能出现障碍，导致碱性磷酸酶偏高。
其他不常见疾病。
其他一些不常见的疾病也可以导致碱性磷酸酶偏高。如：白血病、甲状腺机能亢进、肾小管性酸中毒、乳腺癌、肺癌、卵巢癌、骨细胞瘤、骨肉瘤等可引起碱性磷酸酶偏高。
