在确诊肾绞痛后，医生会根据患者就诊时的疼痛程度，伴随症状如恶心、呕吐以及对止痛药物的反应做相应治疗。治疗用药一般有个梯度：
①疼痛能耐受或肾绞痛后余痛，可选择口服止痛剂和解痉药物。
②疼痛难以耐受，就应肌肉注射阿托品(解痉药物)，一般15—20分钟起作用，但有口干、心跳加速等副作用。
③疼痛剧烈或肌注阿托品20分钟后疼痛仍末缓解者，通常需要注射毒麻类药物如杜冷丁或吗啡，其止痛作用强，同时有镇静作用，肌注后15—20分钟显效，可维持4—6小时。但不宜多次使用，以免成瘾。④如经上述处理疼痛仍未缓解，就需要静脉输液了。有少数顽固的肾绞痛患者，短时间内对各种止痛剂都不敏感，只能在药效的作用下慢慢缓解。
肾绞痛并非独立的一种疾病，而是一种症状。就发病规律而言，肾绞痛伴有血尿，大多由肾与输尿管结石引起，但这不是结石所特有的症状。因此肾绞痛发作缓解后，必须进一步检查病因做相应的治疗，否则可能存在以下两大危险：
首先，不能及时发现尿路梗阻。肾绞痛最常见的原因是尿路结石，有时结石在肾盂或输尿管中嵌顿，不一定出现绞痛，但可以引起梗阻，导致不同程度的肾积水。久而久之，肾积水可以日益加重，最后导致肾功能丧失。在此过程中，患者仅有轻微腰酸或没有明显的症状，容易被忽视。有人把肾脏比做“哑巴”器官，意思是自身有了较严重的病变，却没有明显反应，这也是肾绞痛容易被忽视的主要原因。
其次，可能延误肾肿瘤、结核等重要疾病的诊断。任何原因的肾出血，如形成血块通过输尿管时，都会刺激输尿管而发生痉挛，造成梗阻，出现像肾结石一样的绞痛。因此，肾绞痛后腹部X线拍片看不到结石，不等于就没有问题。
凡有过肾绞痛发作者，应经常化验小便，如发现有血尿，即使无绞痛发作，也说明病变仍存在。必要时，可做B超、静脉肾盂造影等检查。
