1.根据造血干细胞的来源分为骨髓、外周血、脐带血等。
2.根据供受者关系分类
(1)自体造血干细胞移植 将自体正常或疾病缓解期的造血干细胞保存起来，在患者接受大剂量化疗后回输造血干细胞。
(2)同基因造血干细胞移植 指同卵孪生之间的移植。
(3)异基因造血干细胞移植 同胞人类白细胞抗原(HLA)相合、亲缘HLA不全相合或半相合、非亲缘HLA相合、非亲缘HLA不全相合等。
3.根据供受体之间HLA配型分为HLA相合同胞移植、HLA相合非亲缘移植、亲缘HLA不全相合/半相合移植。
4.根据有无细胞体外处理，分为未经体外处理、CD34+细胞富集、T细胞去除、单克隆抗体处理后、化疗药物体外处理净化、体外扩增后细胞及基因修饰细胞等。
5.根据移植前预处理方案分类(1)清髓性移植 如果没有外源性造血干细胞支持，清髓强度使造血系统3个月内无法自行恢复。
(2)非清髓性移植 预处理强度有所降低。如果没有外源性造血干细胞支持，造血系统在3个月内自行恢复。
