睾丸萎缩的治疗可使得病人康复，且能够恢复生育能力，双侧睾丸萎缩可能会导致不育，此时可见生精上皮的严重损害。所以，单侧睾丸受损害后仍然有生殖能力，若双侧受损害，则能造成少精子症或无精子症。由淋病菌感染的睾丸炎或附睾炎，能导致睾丸功能丧失和附睾部分梗阻或完全梗阻。
只要睾丸损伤不是“致命”的，只是部分伤害，即可以通过治疗恢复正常的生育功能。对于睾丸已经完全丧失功能者，应该放弃治疗，采取人工受精的办法生育。不管哪种情况都应该及时的去医院进行诊治，因为这个是比较严重的疾病，医生需要根据实际情况了解之后，才能有最佳的治疗方案。
睾丸萎缩患者应及时到医院查明病因。体检时应注意有无睾丸或睾丸萎缩，及睾丸的质地是否变化，性腺功能低下继发于脑垂体疾病者，睾丸大小可正常或稍小，这与脑垂体疾病的时间长短有关，血清PRL增高也表示脑垂体有问题，常伴有性腺功能低下。患阳痿的病人，血清睾丸酮并不一定都低。怀疑有脑垂体瘤者，需做颅脑X线摄片或CT断层扫描片，以明确诊断。
为了查明睾丸萎缩的病因，从而能够起到针对性治疗。患者应当到医院进行前列腺液、精液、血液检查。此外对肝脏以及肾脏功能、甲状腺功能应当重点检查。还需要对血清睾丸酮进行测定。如果怀疑是阴茎方面原因导致睾丸萎缩，则可以针对阴茎收缩压以及阴茎血流量进行检查。
