1、对正常肝细胞仍有损伤，少数病人甚至出现肝机能不全。
2、操作有一定难度，导管应超选择进入供血动脉疗效才佳，但有时进入肝动脉都很困难。而有的肝癌可多血管供血。
3、肝癌主要供血依赖肝动脉，但癌块周围有门静脉血供，癌细胞可以“苟安偷生”。
4、有的病人一次治疗后血管即堵塞，以致再操作困难。
5、即使操作超选择顺利进行，由于高压注射等原因，可造成误栓，分流及可能有不可避免的微转移产生。
6、对癌块太大者疗效欠满意。
7、已有门静脉癌栓者须酌情考虑或去除癌栓。
对于心血管疾病也可采用介入疗法治疗。如采用球囊扩张技术，改善二尖瓣狭窄，采用支架植入技术，解除胸主动脉狭窄等，这种疗法有旋切、封堵、溶栓、支架等措施，已被公认是治疗心血管疾病的一种新的可靠的疗法。
肿瘤的血管介入疗法按器械导入的部位，分为血管内介入和血管外介入两种。氩氦刀冷冻疗法和血管阻断(栓塞)方法，临床上应用最多最成功的是肝动脉化学栓塞疗法治疗肝癌。
