1.帮助营养物质的消化吸收
许多益生菌株在胃肠道内可产生消化酶，这些酶可帮助人体更好地消化所摄入的食品及吸收食品中的营养成分。益生菌还可竞争性抑制有害微生物吸收营养物质及进入血液循环系统。嗜酸乳杆菌是这方面的代表菌株，可分泌消化乳糖的乳糖酶，从而缓解乳糖不耐症。
2.产生重要的营养物质
益生菌能产生维生素，包括泛酸、尼克酸、B1,B2,B6及维生素K等，同时能产生短链脂肪酸、抗氧化剂、氨基酸等等，对骨骼成长和心脏健康有重要作用。
3.抵抗细菌病毒的感染，提升免疫通过三大步骤，益生菌可清除有害菌对身体的伤害：
1.)抑制有害菌的生长。益生菌通过产生杀灭有害菌的化学物质，及与有害菌竞争空间和资源而遏制它们的生长。
2.)抑制有害菌产生毒素。
3.)清除有害菌产生的毒素。
4.预防和治疗某些疾病，如肠道综合症、呼吸道感染、生殖系统感染、过敏、口臭、胃溃疡等。
人体许多健康问题都是由体内菌群失衡引起，决定因素是微生态的平衡，可通过使体内菌群重新达到生态平衡来实现缓解与治疗的目的。比如腹泻、便秘、阴道感染等综合症状，国内外已经经过多年的研究和实践，证明使用特定的经临床证实的益生菌可有效地进行治疗。
益生菌有许多令人惊奇的功效，但这些不同的功效高度依赖于“菌株的特定性”。也就是说，通过大量和长期的临床研究证实了某个特定的益生菌株具有某种明确的功能，但并不意味着其他同种益生菌的不同菌株也必定有同样或相似的功能。比如，丹尼斯克HOWARUä;瑞卡福抑菌喷剂等优质益生菌系列，经过多年科学研究和临床证实，证明其中某些特种菌株的特定配合，对于缓解某些健康问题，如肠道综合症、过敏、呼吸道感染等有着预防和缓解的功效，尤其是瑞卡福抑菌喷剂更能帮助修复因致病菌感染造成的生殖系统疾病。但并不能说明任何其他的同类菌株产品也有同样的功效。
