1、免疫功能
可表现为自身免疫反应亢进，也可能表现为免疫功能的缺陷，后者多见。某些细菌、病毒等微生物的感染，可能是导致复发性口腔溃疡的重要原因之一。任何会引起免疫功能紊乱的因素，都可能诱发口腔溃疡。
2、精神因素
口腔患者许多是在过度精神疲劳后发病的，事实上，精神紧张、睡眠不足、工作压力大、过度疲劳、精神不佳等，都可以导致到人体内环境失衡，也会激活在体内的病毒，从而导致溃疡更多地发生。
3、内分泌
临床上常常看到女性在月经期间易出现口腔溃疡，常伴有口干、心烦、易怒和大便干结等令人烦恼的症状。临床研究发现，月经期出现口腔溃疡主要是由于体内黄体酮水平增高而雌激素(孕酮等)的水平降低所致。
4、营养元素
维生素及微量元素缺乏也可导致口腔溃疡，研究发现，缺叶酸、缺乏微量元素锌、铁、维生素B12等，可降低免疫功能，某种会导致溃疡的病毒潜伏在口腔粘膜中，粘膜却因为局部营养缺乏导致对其失去抵抗力，溃疡由此产生。
5、消化系统疾病
患系统性疾病的患者易发生口腔溃疡，主要是通过影响免疫系统而致口腔溃疡。口腔溃疡与胃溃疡、十二指肠溃疡、溃疡性结肠炎、局限性肠炎、肝炎等有关。慢性胃炎、胃十二指肠溃疡、便秘等胃肠道疾病患者，复发性口腔溃疡的发病率会明显增高。因为，人体全身黏膜结构是相似的，慢性胃炎、胃十二指肠溃疡等疾病的主要病损在消化道黏膜，它影响人体对维生素的吸收。不爱吃蔬菜水果的偏食者也易得口腔溃疡。
6、慢性病
糖尿病、血液病、结核病等慢性病患者。由于黏膜的营养供应不良，也容易出现口腔溃疡。
7、食物不耐受
如果口腔溃疡反复发作，持续数年甚至十几年未愈，非常有可能与食物不耐受有关。食物不耐受指的是一种复杂的变态反应性疾病，人的免疫系统把进入人体内的某种或多种食物当成有害物质，从而针对这些物质产生过度的保护性免疫反应，产生食物特异性IgG抗体，引起所有组织发生炎症反应。
