1.药物因素
大多数进入母体的药物可以通过胎盘进入胚胎。有些药物可能影响胚胎的发育并导致畸形，目前已知的抗肿瘤药物（如环磷酰胺、甲氨蝶呤等）、抗惊厥药物（苯妥英钠）、抗组胺药和治疗妊娠呕吐的明基和一些安眠药（如沙利度胺）可导致胎儿畸形。
2.物理损伤
例如，在胎儿发育过程中经常接触辐射或微波，可能影响胎儿的生长发育，成为发生唇裂的可能诱因。
3.遗传因素
遗传因素大多是遗传性的，常表现为唇腭裂婴儿的直系或旁系亲属中出现相同的症状。在易导致唇腭裂的因素中，环境因素的影响更为复杂，这里指的是胚胎生长发育的环境。
4.维生素缺乏
例如，在怀孕期间，孕妇可能出现频繁呕吐或偏食，导致维生素A、B、钙、铁、磷、叶酸的缺乏，再如，孕妇在怀孕期间受到刺激和过度紧张。
5.吸烟和饮酒因素
孕早期大量吸烟和饮酒的妇女，其子女唇裂的发生率高于无吸烟和饮酒习惯的妇女，是导致胎儿唇裂发生的可能因素之一。
