(1)三叉神经后根和半月神经节的病变
三叉神经后根的病变(颅后窝)如小脑脑桥角区的表皮样囊肿(胆脂瘤)、神经鞘瘤、脑膜瘤、神经纤维瘤、蛛网膜囊肿或粘连，其次有骨瘤、软骨瘤、血管细胞瘤、胶质瘤及动脉瘤等。半月神经节的病变(颅中窝)，凡是颅中窝脑底部的病变均可侵犯半月神经节，如颅底部的各种肿瘤、颞叶下部脑膜瘤、血管瘤、颅底的转移瘤或颅底的炎症粘连等。以上部位的病变除引发三叉神经痛症状外，对临近组织结构多有侵犯，因此，可出现相应部位症状和体征。如三叉神经系统分布区域的感觉和运动障碍，或同时出现带状疱疹，这一特征性体征的出现，有人认为是诊断半月神经节病变的重要依据。
(2)脑干病变
脑干是几乎所有传导束必经之路和许多重要生命中枢所在地。故脑干一旦出现病变，轻者有神经功能障碍，重者在短期内死亡。引起三叉神经痛的常见病变有延髓空洞症、脑干血管病变、炎症、肿瘤、每度、多发性硬化等。
(3)半月神经节前根(周围支)病变
此部位的病变最常见的有眶内肿瘤、眶上裂区炎症或肿瘤、海绵窦的病变、副鼻窦的炎症或肿瘤以及牙源性病灶等，均可侵犯三叉神经的根或周围支而发生三叉神经痛。
