一般情况下，小而无症状的囊肿一般无需治疗，也不会影响生育。如果病情发展，囊肿增大，没有生育要求的话可以手术治疗，因为手术可能破坏附睾管而影响生育。无症状者不需治疗，症状较重或囊肿体积较大且已婚有子女者可行手术摘除。手术有可能破坏附睾管而影响生育，所以没有结婚的患者要慎重。
附睾炎囊肿会直接影响男性的生育能力及男性健康
1、临床研究发现附睾炎是会影响生育的，这主要原因是当睾丸产生精子后，并不具备与卵子结合的能力，而附睾这时就起到作用了，附睾是为精子成熟提供环境的地方，当精子在附睾里成熟之后，才能获得活动的能力，因此说，附睾如果出了问题，很可能就会引起男性不育症。
2、可导致死精、无精、丧失生育能力，并且将炎性病菌传染给配偶，造成妇科疾病，给妻子带来巨大伤害。从而丧失生育能力。
3、附睾炎可导致男性性功能下降，甚至完全丧失性功能，给夫妻生活带来困难。
4、精损肾亏早衰。附睾炎若久治不愈易造成精神状态不好，身体虚。而这些都是影响生育的因素。
一般小的附睾囊肿(小于1cm)不需要特别处理，小的囊肿但症状很严重，也可以考虑做附睾切除，但一定要生育以后，因为附睾切除了，一侧睾丸产生的精子就排不出来了，一侧睾丸就等于丧失了生育能力，所以要综合考虑。
