目的在于缓解症状，防止复发，减少肾实质的损害。鼓励患者多饮水，勤排尿，勿憋尿，以降低髓质渗透压，提高机体吞噬细胞功能，冲洗掉膀胱内的细菌。有发热等全身感染症状应卧床休息。
1.急性肾盂肾炎
引起尿路感染的主要细菌是革兰阴性菌，其中以大肠杆菌为主。感染严重有败血症者宜静脉给药。根据尿细菌培养结果选用敏感药物。
新生儿、婴儿和5岁以下的幼儿急性肾盂肾炎多数伴有尿道畸形和功能障碍，故不易根除，但有些功能障碍如膀胱输尿管反流可随年龄增长而消失。一次性或多次尿路感染在肾组织中形成局灶性瘢痕，甚至影响肾发育，近年来主张用药前尽可能先做中段尿细菌培养，停药后第2、4、6周应复查尿培养，以期及时发现和处理。
2.慢性肾盂肾炎
急性发作者按急性肾盂肾炎治疗，反复发作者应通过尿细菌培养确定菌型，明确此次再发是复发或重新感染。
(1)复发 指治疗后菌株转阴性，但在停药后的6周内再发，且致病菌和先前感染的完全相同。复发的常见原因有：①尿路解剖上或功能上异常，引起尿流不畅。可通过静脉肾盂造影或逆行肾盂造影以明确之，如有明显解剖异常情况存在，需手术加以纠正。如果梗阻因素难以解除，则根据药敏选用恰当抗菌药治疗6周。②抗菌药选用不当或剂量和疗程不足，常易复发，可按药敏选择用药，治疗4周。③由于病变部位瘢痕形成，血流量差，病灶内抗菌药浓度不足，可试用较大剂量杀菌类型抗菌药治疗，疗程6周。
肾盂肾炎一年内如尿感发作在3次或3次以上的者又称复杂性尿感，可考虑长时间低剂量治疗。一般选毒性低的抗菌药物治疗。男性因前列腺炎引起复发者，宜同时治疗慢性前列腺炎，选用脂溶性抗菌药物。如果经两个疗程的足量抗菌治疗后，尿菌仍持续阳性，可考虑长时间低剂量治疗。
(2)再感染 指菌尿转阴后，另一种与先前不同的致病菌侵入尿路引起的感染，一般在菌尿转阴6周后再发。妇女的尿路感染再发，85%是重新感染，可按首次发作的治疗方法处理，并叮嘱患者重视尿路感染的预防。
