抗病毒药物治疗，可参照中国疾病预防控制中心性病控制中心2006年颁布《性传播疾病临床诊疗指南》[3]，并作适当调整。除此以外，应配合心理治疗和中医药治疗。
一、抗病毒治疗阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦等治疗生殖器疱疹可以减轻症状，缩短病程，减少排毒。
(一)初发感染 阿昔洛韦200mg，5次/d，连服7~10d;或阿昔洛韦400mg，3次/d，连服7~10d;或伐昔洛韦300mg，2次/d，连服7~10d，或泛昔洛韦250mg，3次/d，连服7~10d。
(二)复发感染 最好在出现前驱症状或损害出现24h内开始治疗。阿昔洛韦200mg，5次/d，连服5d;或阿昔洛韦400mg，3次/d，连服5d;或伐昔洛韦300mg，2次/d，连服5d;或泛昔洛韦125~250mg，3次/d，连服5d。
(三)频繁复发(1年复发6次以上)患者 为减少复发次数，可用抑制疗法。阿昔洛韦400mg，口服，2次/d;或伐昔洛韦300mg，口服，1次/d;或泛昔洛韦125~250mg，口服，2次/d。以上药物均需长期服用，一般服用4个月到1年。
(四)严重感染 指原发感染症状严重或皮损广泛者。阿昔洛韦每次5mg~10mg/kg体重，静脉点滴，1次/8h，用5~7d或直至临床症状消退。
(五)对发生于免疫缺陷者的生殖器疱疹可按上述方案治疗，必要时可适当延长疗程。
生殖器疱疹(六)妊娠期疱疹 需权衡母婴的利弊选择适当的抗病毒药物和方案。目前主张，孕妇初发生殖器疱疹可以口服阿昔洛韦治疗;有严重并发症可危及生命者，应静脉滴注阿昔洛韦治疗;对于频繁复发或新近感染的孕妇生殖器疱疹患者，在足月时，可通过阿昔洛韦治疗以减少活动性损害的出现，从而降低剖宫产率;对于以往有复发性生殖器疱疹病史但近足月时无复发迹象的孕妇，可以不进行阿昔洛韦治疗。
(七)新生儿疱疹 阿昔洛韦30～60mg/(kg.d)，静脉滴注，疗程为10～21天。
二、局部治疗 保持患处清洁、干燥。皮损处可外涂3%阿昔洛韦霜、1%喷昔洛韦乳膏和酞丁胺霜等。若有继发细菌感染，应加用抗生素。
三、中医药治疗 复发性生殖器疱疹患者往往具有劳累、心理焦虑等情况，因此在积极抗病毒治疗的同时，可给予一些健脾利湿、清热解毒和养肝滋肾、滋阴清热的中药，如参苓白术散和知柏地黄丸等，对部分患者有效。
四、心理治疗 由于本病很易复发，反复发作常给患者带来烦恼和焦虑，应耐心、细致地对患者进行心理治疗，鼓励病人增强战胜疾病的信心，积极配合治疗。
五、预防 预防生殖器疱疹的传播应从消灭传染源、切断传播途径和提高易感人群的免疫力三方面入手。提高易感人群保护性免疫力的方法是疫苗的使用，据目前资料，找到高效预防HSV感染的疫苗已为期不远了。
