口腔粘膜柔嫩，血管丰富，唾液分泌量少，均有利于微生物的繁殖，导致口腔感染。
新生儿期最常见的口腔感染是白色念珠菌感染，俗称“鹅口疮”。主要是母亲奶头或喂奶者的手污染引起的。表现为口腔粘膜上出现点状或小片状白膜，不易拭去，无疼痛感，也不影响吃奶。但当抵抗力低下时，病变可蔓延至咽喉、食管、气管、肺等处，引起严重感染。因而得了“鹅口疮”后应尽早去医院治疗。
“鹅口疮”是可以预防的。母乳喂养时，应保持乳房及乳头的清洁，哺乳结束时，可挤出少量乳汁，涂于乳晕部，待其自然干燥。因乳汁有抑菌作用，可避免感染。采用人工喂养时，每次奶瓶、奶头用后都要清洗干净，并煮沸消毒。其他喂奶用的物品，如小毛巾等都要与成人分开，每次用后煮沸消毒，太阳晒干。平时大人喂奶前或接触宝宝前都要注意洗净双手，做到预防为主。
新生儿口腔的上腭中间及牙龈上有的可出现黄色的小颗粒或黄色的小结节，主要是上皮细胞堆积所致，俗称“马牙”或“鼓氏珠”。这都是生理现象，千万不要用棉签擦拭或用针挑破。一般数周后会自行消退。
