遗传因素
大约60%的偏头痛患者有偏头痛家族史，其亲属患偏头痛的风险是普通人群的3至6倍。在家族性偏头痛患者中没有发现一致的孟德尔遗传模式，反映了不同的外显率和多基因遗传特征与环境因素的相互作用。家族性偏瘫性偏头痛显然是一种常染色体显性遗传，具有较高的异常外显率，并被定位在三个疾病位点，即19P13（与大脑表达的电压门控P/Q钙通道基因的不匹配突变有关）、1Q21和1Q31。
内分泌和代谢因素
本病在女性中比男性更常见，倾向于在青春期发病，在月经期间容易发作，在妊娠期或绝经后减少或停止。这表明，内分泌和代谢因素参与了偏头痛的发展。此外，5-羟色胺（5-HT）、去甲肾上腺素、P物质和花生四烯酸的代谢异常也可影响偏头痛的发病。
饮食和精神因素
偏头痛发作可由某些食物和药物引发。食物包括含有酪胺的奶酪、含有亚硝酸盐防腐剂的肉类和腌菜、含有苯乙胺的巧克力、食品添加剂如味精（MSG）、红葡萄酒和葡萄酒。药物包括口服避孕药和血管扩张剂，如硝酸甘油。此外，一些环境和精神因素，如压力、过度劳累、情绪紧张、睡眠过多或过少、月经和强光等，也会诱发。
