输精管缺陷也可分为完全性或部分性缺陷。后者又可细分为外部和内部缺失。据专家介绍，输精管常常伴随着精囊的缺失或纤维化。在某些情况下，还合并有附睾发育不良或射精管缺失，输尿管或膀胱三角区也可能出现异常，但睾丸是正常的。这是由于输精管、附睾、精囊和射精管都起源于中肾管，而睾丸则起源于生殖器嵴。在双侧输精管的患者中，大多数人合并有精囊缺失。精囊分泌物是精液的主要成分，呈碱性，决定了精液的粘稠度。
这是因为输精管在胚胎发育过程中，由于中肾管的停滞、闭锁或变性而造成。而1%至2%的不育男性患有双侧输精管缺失症。由于没有输精管，精子就不能输出体外，自然生育也就不可能。这种疾病的主要临床表现是不孕不育或无精子症。患者常因婚后长期不孕而就诊，在影像学上可看到输精管。
如果有输精管，但由于发育不良而无法进入内腔，则称为先天性输精管梗阻。然而，它应与输精管的炎症和肿瘤相区别。输精管缺失严重影响男性不育，所以应及时治疗。
