1.胚胎发育的影响
认为在 胚胎发育的第7周，泄殖腔膜和肛膜破裂与后肠融合，此时泄殖腔膜的背侧部分衍生为肛管、齿状线和肛柱的下部，若由于某种原因造成肛膜与后肠之间发生异常融合不能形成正常齿状线和隐窝而形成不规则齿状线和过深隐窝，出生后容易受细菌感染和损伤形成肛窦炎、肛周脓肿和肛瘘。临床观察证实肛周脓肿和肛瘘患者的肛隐窝常异常加深可深达3～10mm，数目可增至3～13个健康搜索，胚胎发育影响着肛窦的学说已为专家广泛认可。
2.感染与损伤
肛 窦因窦底在下开口朝上，呈袋状，引流差，容易贮藏粪便引发感染和损伤，肛窦的边缘又有游离的半月形鶒的肛瓣，也容易受到干粪块鶒的擦伤或被排便时撕裂。排便次数增多或患肠炎、痢疾、腹泻便秘等，频繁刺激肛窦和肛瓣。身体和局部抵抗力降低，或有周身慢性消耗性疾病，粪便和异物存积肛窦，窦道受到阻塞使肛腺分泌的肛液引流不畅，加上粪便分解，病菌繁殖，肛窦即发炎肿胀。
3.性激素的影响
与 皮脂腺一样，肛腺的发育与功能主要受人体性激素的调节，性激素的高低直接影响着肛腺的增生与萎缩，因此性激素的水平与肛窦炎的发生有密切关系。而性激素中以雄激素的影响最大。人一生中，新生儿体内由母体带来的雄激素较多，故肛周感染较多，一过发育成长期，随雄激素水平下降，肛周感染有的可自愈男性及青壮年雄激素水平较高，故而肛腺感染增多，肛周脓肿常发于青壮年。老年性激素水平明显下降，肛腺随之萎缩因此老年很少发生肛窦炎及肛周感染。
4.肛窦炎并因的中医解读
肛窦炎多因饮食不节，过食游酒厚昧和辛辣等刺激性食物，或因泄泻和痢疾等湿热之邪下注肛门，或因肠燥便秘、虫积骚扰，以致肛门破损、感染而成。
肛窦本身易被堵塞，一旦受感染，就不易被清除。粪便积存肛窦内时，利于细路的侵入和繁殖，从而导致受侵犯的肛窦产生炎症、水肿及渗山液增多。炎症继续向外扩散到肛腺周围，肛瓣和肛乳头常因受刺激而充血、水肿或增生肥大。
