流感病毒感染可由单纯性转变为肺炎或直接转变为肺炎，肺炎是由流感病毒感染从上呼吸道扩散到下呼吸道而引起的。有报道称，基础性疾病的报告未经证实。
肺炎型流感的典型发病特点是持续高热，迅速出现呼吸困难、发绀、剧烈咳嗽，并有泡沫状粘液痰或痰中带血；检查发现两肺呼吸音低，满是鸡冠状，但无实体症状。胸部X光片显示双侧肺部有散在的絮状阴影，从肺门向周边扩散；表现与成人呼吸窘迫综合征（ARDS）一致，病人可能死于心力衰竭或外周循环衰竭。病程可长达3至4周。血气分析显示明显缺氧。
流感病毒很容易从痰中分离出来，痰涂片革兰氏染色可见到许多嗜中性多核粒细胞；但是，痰和血培养没有显示致病菌的生长，抗菌治疗无效，死亡率可超过50%。婴幼儿和老年人的流感常影响下呼吸道，尤其是导致肺炎，约有1/4因下呼吸道感染住院的小儿病例是由流感病毒引起的。老年人流感性肺炎和支气管炎的发病率随年龄增长而增加，从60-69岁年龄组的36%到70岁以上年龄组的高达73%。老年人的肺炎往往缺乏初始症状，容易被忽视，而肺炎的出现往往伴随着明显的脱水、酸中毒或意识障碍等危急情况。
