1、肛瘘很少自愈，都需要治疗。上述普通肛瘘、直肠会阴瘘可用“挂线疗法”治愈，其他瘘则需要手术治疗或挂线与手术相配合的疗法。肛瘘挂线很简单，门诊手术即可完成。
2、为预防和减少新生儿和小婴儿发生感染性肛瘘，必须注意肛门卫生。家长习惯在换尿布时顺手用尿布擦一下肛门和外阴，并且误认为尿布很干净，也很柔软，其实对新生儿和小婴儿来讲，尿布还是有些粗糙和不卫生的。
3、最好在便后用装有温水或硼酸水的小壶冲洗肛门和外阴，然后再用干净的棉花或软布轻轻擦干，并涂以少量软膏(金霉素眼药膏或鞍酸软膏)。这样就能减少肛门周围皮肤及外翻的直肠粘膜的损伤，达 到预防感染的目的。
4、养成BB定时大便的习惯。可以定时把大便或者早晨定时练习坐盆。
5、稀释奶粉：便秘时可先在奶粉里多加一部分水或米汤将其稀释，或每晨口服二茶匙蜂蜜，但量不宜多，以免引起腹泻。还可以吃婴儿清火宝或奶伴侣。
6、调整饮食：多吃“三养”食物。
(1)养肠胃，即一些富含粗纤维的蔬菜水果，如菠菜、芹菜、竹笋、苹果及一些具有润肠通便作用的食物，如蜂蜜、核桃仁、香蕉、芝麻等。
(2)养肺，除了用人们熟知的银耳、百合、生梨等拌蜂蜜煮粥或炖汤外，还可多让孩子吃些山药、荸荠、萝卜及大蒜、洋葱，也都能起到清心润肺，防治呼吸系统、消化系统疾病的作用。
(3)养身，孩子多吃些颜色深的水果也可以起到预防伤风感冒的作用。芒果、黄桃、猕猴桃等深色水果的维生素C含量都比较高，对于抗感冒、增加身体反抗力有很好的效果。
7 、多喝水，可以给BB喝果汁或煮菜水喝。每天用萝卜半个，梨(带核)一个煮水。
8、平时或大便前围绕肚脐顺时针方向按摩腹部，刺激肠蠕动。如果有形成肛裂的，较轻可以温水坐浴，保持清洁。
9、每天吃一点酸奶，注意是全脂酸牛奶(原味、草莓的都行)，不是乳酸饮料(后者没有多少营养)，特别有改善!
10、如果小儿因大便干燥而3-4天都排不出，家长在家里可以采取一些临时性措施，如可以用消毒好的棉千沾消毒好的植物油轻轻刺激肛门，也可以坐在温水中刺激肛门也会大便的，也可用小儿开塞露塞入肛门或挤入少量甘油。要注意开塞露开口处不要剪得凹凸不平或非常锋利，以免在塞入时划伤肛门;在挤入甘油后一定要停留几分钟，待小儿有便意时再排便。如果没有开塞露，在家庭中可用软皂头上滴点水，这样就很容易塞入肛门而减少小儿的惊恐与不适。
