(一)药物治疗
急性扁桃体炎有传染性，应适当隔离。因本病多为链球菌感染，身应用抗菌素及磺胺类药物，疗效较好。抗生素首选青霉素，青霉素过敏者可选用红霉素、林可霉素等。高热头痛及全身酸痛者可选用阿司匹林等解热镇痛剂。经2—3日治疗后如病情无好转，则应考虑是否病毒或其他细菌感染，改用抗病毒药、敏感抗生京或磺胺类药物，可酌情使用肾上腺皮质激素，如泼尼松、地塞米松等。此外，应注意休息、通大便、多饮水、冷流食，并给适量退热止痛药、漱口药水等，多数患者可在1周左右恢复。急性化脓性扁桃体炎：全可用朵贝尔氏液含漱，4小时1次。两侧下颌角部位热敷或超短波透热理疗有消炎作用。
(二)手术治疗
慢性扁桃体炎尚无肯定有效的保守疗法，但中药、扁桃体局部用药、冷冻、理疗等皆有人试用。也可进行扁桃体切除术。过去，为防止扁桃体病灶引起严重并发病，扁桃体切除术甚为普遍。近年由于认识到扁桃体具有免疫功能，对切除扁桃体是否有益发生争议。故手术已较前有所减少。对手术适应症、手术效果及切除扁桃体是否会影响机体免疫功能等也存在不同见解。据近年研究，扁桃体参与体液免疫和细胞免疫，可以产生合成各种免疫球蛋白的B淋巴细胞。
因此有人认为切除扁桃体可以影响局部免疫功能，但对全身免疫功能无影响。以下情况可以行扁桃体切除术：
①反复急性发作或有扁桃体周围脓肿史者;
②可能是引起其他部位病变的原发病灶;
③影响正常呼吸或吞咽功能。为防止对免疫功能有不良影响，一般在6岁以前不行扁桃休切除术。影响吞咽及呼吸者，可以切除一侧扁桃体，以解除功能障碍。有出血倾向，继发病活动期手术可能造成继发病恶化以及病人健康条件不允许时，则不应手术。
扁桃体切除主要有两种方式，即剥离法和挤切法。剥离法对周围组织损伤小，可以适用于各种情况，故为多数医生采用。挤切法的最大优点是快，手术可在1～2分钟完成，但对粘连多、有过扁桃体周围脓肿史及可能有血管异常者不宜采用。扁桃体手术本身也可出现并发症，如术后出血、感染、局部损伤等。少数病例术后可出现咽干、咽部淋巴组织代偿性增生等。
手术效果与适应症的选择是否恰当，手术操作的好坏及病人的生理、心理状态有关。就疾病本身而言，反复急性发作，扁桃体肥大而致影响正常生理功能，扁桃体周围脓肿和扁桃体良性肿瘤等，疗效肯定。对合并有肾炎、风湿病、低烧等全身性疾病者，其疗效则各家说法不一。扁桃体切除仅是将一个可能的致病原因去除，对其他部位的器质性病变并无作用，也不能影响其他的致病因素。
