1、细菌、病毒：通常诱发扁桃体炎最根本的病因便是细菌、病毒，而诱发扁桃体炎最常见的致病菌便是链球菌。
2、抵抗力低下：当人体抵抗力低下时，极易导致扁桃体炎的发生，诸如儿童、患有慢性疾病的病人，以及精神压力过大的工作一族等。
3、季节因素：通常扁桃体炎的病发，与季节也有一定的联系，诸如换季时，气温起伏过大，导致身体免疫力出现异常，最终诱发扁桃体炎的发生。
4、邻近器官组织炎症：诸如咽喉部位疾病、鼻部疾病以及耳部疾病，都可能导致炎症蔓延至扁桃体，造成扁桃体炎的病发。
5、身体其他疾病：诸如支气管炎、气管炎、肺炎等疾病，以及营养不良等的急慢性炎症，也极易导致扁桃体炎的发生。
慢性扁桃体炎时，隐窝内上皮坏死脱落，细菌及炎性渗出物聚集其中，隐窝可产生小溃疡及瘢痕形成而引流不畅，适于细菌生长繁殖，故感染不易消除。屡发急性扁桃体炎，使机体抵抗力降低或治疗不彻底，则更易转为慢性。
急性扁桃体炎常发生于儿童及青少年。主要致病菌为乙型溶血性链球菌，葡萄球菌，肺炎双球菌。腺病毒也可引起本病。当机体抵抗力因寒冷，潮湿，过度劳累，体质虚弱，烟酒过度，有害气体刺激等因素骤然降低时，细菌繁殖加强所致。有时则为急性传染病的前驱症状，如麻疹及猩红热等。
