如何确定肝移植的时机是很重要的，也就是说，在慢性疾病进展的哪个阶段，肝移植会给病人带来最好的结果和预后。
食管胃静脉曲张破裂出血，每次造成30-50%的死亡，70%的患者在2年内再次出血；顽固性腹水，6个月的生存率只有60%；10-15%的终末期肝病患者发生自发性腹膜炎，易复发，每次造成50%的死亡。和肝性脑病，如果药物治疗效果不佳，那么其1年生存率只有15-40%；因此，当慢性肝病患者出现一种或多种与门静脉高压或肝衰竭有关的并发症时，应考虑进行肝移植。如反复发作的食管胃底静脉曲张出血、难以控制的腹水、肝性脑病、凝血功能障碍、反复发作的自发性腹膜炎和肝肾综合征；2.严重嗜睡、难以控制的瘙痒、严重的代谢性骨病、复发性化脓性胆管炎导致生活质量下降；3.实验室检查：血浆蛋白低于30g/L，凝血酶原时间（PT）高于正常控制值5秒以上；血总胆红素大于50-100mg/L。
当慢性肝病患者出现上述情况时，往往意味着生存时间较短，一般不超过6-12个月，一旦进入重症肝病终末期，患者往往需要重症监护和辅助呼吸来维持呼吸和循环功能，不进行肝移植往往难以生存1-3个月，肝移植风险高，移植后住院时间长，费用明显增加。因此，在疾病的非晚期阶段（即患者的肝病进展不太严重时）进行肝移植，可以降低围手术期的风险，改善生活质量，并能显著降低治疗费用。
