1、性生活过频：过频的性生活，常会引起输精管、精囊及尿道部位产生无菌性炎症，致使这些部位充血水肿。射精时，由于平滑肌收缩，而刺激这些充血的部位，引起射精疼痛。
2、结石：男性尿道结石是导致射精疼痛的常见疾病，当小的结石嵌在后尿道，尤其嵌在射精管的开品部位，射精时这些部位收缩和蠕动，挤压结石而产生疼痛。如前列腺或精囊有结石，射精时这些部位收缩而产生疼痛。
3、生殖部位炎症：男性下尿路感染是导致射精疼痛最常见的原因。患有膀胱炎、尿道炎、，射精时，这些部位的肌肉发生节律性收缩，对炎症病灶是一种机械刺激，以致引起剧烈疼痛。有的患者还会发生疼痛性遗精。
4、肿瘤：男性泌尿生殖部位的恶性肿瘤，大多会引起射精疼痛。如睾丸、附睾、前列腺等处发生肿瘤时，压迫或阻塞射精管道，射精时会发生疼痛。不过，其疼痛性质较为缓和，多是隐痛和酸痛。精囊，输精管等处发生肿瘤的机会虽然不多，但病变的进展多为隐匿性。因此，这种疼痛应引起重视。
