泌尿生殖系统炎症包括睾丸炎、附睾炎、精囊炎、前列腺炎、尿道炎等，这类患者在少精子症中比例最多。治疗方法目前提倡综合治疗，首先要应用抗生素2——3周，炎症一旦解除，睾丸的生精功能也容易恢复，随后可辨证使用一些中药。此外，生活调理不应忽视，要注意休息，炎症急性期应避免房事等。
由于睾丸温度升高及毒素淤积等原因使睾丸生精功能受到影响，引起少精症，严重的可造成无精症。
隐睾据报道，单侧隐睾患者约有30%--60%不育，双侧隐睾则有50%-100%发生不育，少精症中隐睾患者约占9%。隐睾本身除了曲细精管退化影响生精之外，另一侧下降完全的睾丸也可能有不同程度的损害，原因可能是由于隐睾产生的抗精子抗体对正常睾丸的影响。该病如果在早期得到有效的治疗，生精功能可恢复。
脑垂体瘤脑垂体是一个重要的内分泌腺体，垂体瘤可以引起性功能下降、睾丸萎缩、少精或无精。治疗方法有药物治疗和手术治疗两种选择。
不良生活习惯如嗜好烟酒、穿紧身衣、洗桑拿浴也会导致男性少精症，还有长期接受电磁辐射和高温作业的人，其睾丸生精功能会明显下降。以上情况引起的少精症，只要改变生活习惯或是工作环境，生精能力很快就恢复，一般不必用药。
