滴虫性阴道炎的治疗方法很多，也有效，但往往不易彻底治愈。治疗必须针对阴道滴虫的生活特点(包括抗药性及宿主机体的情况)，选择适宜的疗法才能获得理想的疗效。
一、局部治疗
(一)增强阴道的防御能力：用0.5～1%乳酸或醋酸或1∶5000高锰酸钾溶液冲洗阴道，或加用葡萄糖粉撒入阴道，以恢复阴道的正常生理防御功能，抑制滴虫的生长繁殖，以达到预防发病的目的。
(二)抗滴虫药物：灭滴灵(metronidazole)片剂200～400mg或栓剂(0.5g)，于阴道冲洗后放入阴道，每晚1次，10天为1疗程。或用卡巴砷(carbarson)200mg或滴维净(devegan)1片，用法同上。为了预防复发，并于第二、三次月经干净后重复用药1周。同时取阴道分泌物检查，经连续3次检查均阴性者为治愈。
二、全身治疗
由于滴虫在人体内多处寄生的特点，滴虫性阴道炎患者常伴有肠道或泌尿系滴虫感染。因此，滴虫不仅可寄生在阴道及阴道粘膜的皱襞内，还可寄生在泌尿道及宫颈腺体的深处。单纯局部用药不易彻底根治，往往需要结合全身用药治疗。灭滴灵为高效杀灭滴虫的药物，口服吸收好，疗效高，毒性小，应用方便，男女皆宜，灭滴灵200mg，每日3次，共用7天;同时每晚用灭滴灵200mg作为阴道坐药。近年，应用灭滴灵2g，作一次性投药，比200mg每天3次连服7天效果好。单次量经济、可靠，疗效高，病人用药后24小时内不能饮用含酒精的饮料。一次大剂量无效者，可改用0.5～1g，每日2次，共7天。必要时可做灭滴灵敏感试验，如属敏感者再投药效果更好。
服灭滴灵后，特别是大剂量一次性投与，个别人可出现恶心、呕吐、眩晕及头痛或皮疹、粒细胞减少等。早孕期服用，有导致胎儿畸形的可能，故在孕20周之前以局部用药为宜，应避免口服。曲古霉素对滴虫、霉菌、阿米巴原虫等都有抑制作用，必要时可口服曲古霉素10～20万U，每日2次，服5～7天。在治疗期间应注意卫生，避免性交，每天换内裤，对反复发作的患者，应令其爱人同时治疗，口服灭滴灵，用法同上。
