传染性软疣的早期症状表现为米粒大小突出于皮肤表面的增殖物，起初表现为淡褐色或者跟皮肤颜色相近的圆形增殖，边缘清晰可辨。传染性软疣在初期的时候具有较强的传染性，病毒是潜伏于皮肤底层具有较强的传染性，患者感染HPV病毒(HPV病毒【译】：球形DNA病毒，能引起人体皮肤黏膜的鳞状上皮增殖。经正规系统治疗后，该病毒会被人体清除。)则说明自身免疫力比较低下，所以初期发现症状其传染性是比较强的。
传染性软疣被感染之初，驻扎于人体，并开始适应人体。此时还是以病毒状态存在，病毒尚未开始繁殖，人体也未作出反应，但病毒却在人体内隐匿着。病毒状态的传染性软疣不表现任何症状。
患者在感染传染性软疣的14-20天开始发病，抵抗力非常弱的患者可能在7天后便表现症状，而身体素质较好的人，也可能在180天后才开始发病。所以，感染传染性软疣的患者，可回想之前的那段时间是否跟可疑的人接触，或进行不安全的活动(如公共泳池或澡堂洗浴)等。
大部分的性病都有潜伏期，把性接触作为传播途径的传染性软疣也不例外，当病毒侵入人体之后，开始与人体系统产生反应，并开始大肆繁殖。此时病毒已扩展，传染性软疣的症状正在含苞待放之时。
传染性软疣是长在患者体表的一个个小小的丘疹，多为半球状的小水泡，中间微微下凹，并且光滑呈肤色或乳白色、淡红色。传染性软疣较小，一般直径在1-8mm之间，挤压疣体，会出现干酪一样的内容物。
