一般无症状。下方虹膜近瞳孔缘区域好发。临床上分为2种类型：局灶性虹膜痣和弥漫性虹膜痣。
1.局灶性虹膜痣 虹膜近瞳孔缘或中周部、周边部、偶见房角处。大小不一，边界清晰，轻度隆起，一般为棕黑或深黑色，色素变异较大，典型的虹膜痣无血管。绝大多数虹膜痣稳定不发展，极少数可影响邻近组织近瞳孔缘虹膜痣可致瞳孔变形瞳孔缘色素外翻但并不表明虹膜痣恶变。多数呈圆形或不规则形的扁平黑色素性斑块或稍突出于虹膜表面，但其厚度一般不超过1mm. 有些色素痣范围较大，可从虹膜周边部延伸到瞳孔缘。虹膜周边部色素痣亦可波及到前房角部位。有些色素痣周围伴有“卫星灶”分布的小病灶。大多数虹膜色素痣比较稳定，无明显的生长倾向。临床症状多与色素痣的部位、体积和对邻近组织的影响有关。发生于虹膜中部、体积较小的色素痣一般无明显症状，常在眼部常规检查时偶然发现;而发生于虹膜根部或瞳孔缘部，或体积较大的色素痣通常因对邻近组织的影响，出现不同的临床症状。虹膜根部的色素痣可波及到前房角组织，引起眼压增高。瞳孔缘附近的色素痣出现瞳孔变形或虹膜外翻。有些色素痣伴有邻近晶状体非进行性、局限性浑浊。极少数表现为双眼多发性色素痣，多数伴有神经纤维瘤病。
2.弥漫性虹膜痣 大多数属于先天性病变，有些病例可能属于眼黑变病或虹膜色素痣综合征的 一种表现。主要特点为色素痣体积较大，累及虹膜一个象限或大部分虹膜，但病灶仍为扁平状黑色素性斑块。有些患眼的虹膜颜色明显深于对侧健眼，类似于虹膜异色症。较扁平，常累及整个或部分虹膜。有些是虹膜痣综合征(Cogan-Reese综合征)的一种临床表现。Cogan-Reese综合征与原发性虹膜萎缩，Chandler综合征同归于虹膜角膜内皮综合征(iridocorneal endothelial syndrome，ICE综合征)，临床表现为单眼青光眼、角膜水肿、虹膜异色、虹膜基质粗糙外露、虹膜多发结节瞳孔变形瞳孔缘色素外翻、虹膜周边前粘连等。其病理机制为特发性角膜内皮增生伴有继发性虹膜病变。大多数属于先天性病变，有些病例可能属于眼黑变病或虹膜色素痣综合征的 一种表现。主要特点为色素痣体积较大，累及虹膜一个象限或大部分虹膜，但病灶仍为扁平状黑色素性斑块。有些患眼的虹膜颜色明显深于对侧健眼，类似于虹膜异色症。
